—— Zhejiang CDC, Macro & Micro-Test және China CDC бірлескен зерттеуі Frontiers in Cellular and Infection Microbiology журналында жарияланды.
Зерттеуге шолу
2026 жылдың мамыр айында Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (JCR Q1, IF ≈ 4.6) басылымы Чжэцзян провинциясының Ауруларды бақылау және алдын алу орталығының (Чжэцзян CDC) басшылығымен, Beijing Macro & Micro-Test Bio-Tech Co., Ltd. компаниясының биоинформатика тобы мен Ұлттық жұқпалы ауруларды бақылау және алдын алу институтының (China CDC) бірлескен авторларымен мақала жариялады. Зерттеудің тақырыбы:
«Қытайдың Чжэцзян провинциясындағы жеті Brucella abortus штамдарын анықтау және филогенетикалық талдау».
Бұл зерттеу Қытайдың Чжэцзян провинциясындағы Brucella abortus (B. abortus) бактериясының алғашқы жүйелі, тұтас геномға негізделген филогенетикалық бақылау талдауын білдіреді. Топ 2015 жылдан 2025 жылға дейін жиналған жеті изолятты (Цзиньхуа, Цюйчжоу және Нинбодан алынған төрт адам тектес және үш ірі қара тектес штамм) талдады. Зерттеу нәтижелері Қытайдың шығысындағы атиптік оңтүстік эпидемиялық аймақтағы осы «солтүстік доминантты түрдің» шығу тегі мен берілу жолдары туралы геномдық дәлелдер келтіреді.
Анықтама және маңыздылық
Бруцеллез - Brucella туысының бактерияларынан туындайтын зоонозды ауру. Brucella abortus негізінен ірі қара малды жұқтырады, бірақ адамдарда да ауру тудыруы мүмкін. Қытайда бруцеллез айтарлықтай географиялық айырмашылықты көрсетеді: ең жоғары ауру солтүстік провинцияларда (мысалы, Ішкі Моңғолия, Шаньси, Хэйлунцзян) кездеседі. Керісінше, Чжэцзянды қоса алғанда, оңтүстік провинцияларда Brucella melitensis бұрыннан басым болған, B. abortus жағдайлары өте аз тіркелген. Бұл аймақтық айырмашылық Чжэцзяндағы B. abortus генетикалық сипаттамасын және көзін іздеуді қоғамдық денсаулық сақтаудың негізгі басымдығына айналдырады.
Әдістер және негізгі тұжырымдар
Зерттеу тобы молекулалық биология мен биоинформатиканы біріктіретін көп бағытты стратегияны қабылдады:
1.Патогенді анықтау және негізгі типтеу
BCSP-31 генінің ПТР және AMOS-ПТР барлық жеті изоляттың B. abortus екенін растады.
Тоғыз үй шаруашылығы геніне негізделген Multilocus тізбекті типтеу (MLST) барлық изоляттардың ST2 тізбектілік түріне жататынын көрсетті, бұл Чжэцзяндағы айналымдағы B. abortus штамдары арасында жоғары генетикалық біртектілікті көрсетеді.
2.Тұтас геномды сипаттау
Тұтас геномдық секвенирлеу Illumina NovaSeq платформасында жүргізілді. Орташа нуклеотидтік сәйкестік (ANI) талдауы Чжэцзян изоляттарының B. abortus 544 эталондық штаммымен 99,99%-ға дейін ұқсастыққа ие екенін көрсетті.
Пан-геномды талдау популяцияның жоғары деңгейде сақталғанын көрсетті: 3084 негізгі ген, сонымен қатар тек 10 қабық гені анықталды, ал жұмсақ негізгі немесе бұлтты гендері анықталмады.
3.Вируленттілік және микробқа қарсы төзімділік генінің профильдері
LPS биосинтезі, T4SS секреция жүйесі және BvrR-BvrS екі компонентті реттеу жүйесі сияқты классикалық жолдарды қамтитын вируленттілікке байланысты барлығы 68 фактор болжанған. Атап айтқанда, барлық изоляттарда bmaA және btaF адгезин гендерінің болмауы байқалды. Резистенттілік генін талдау CARD дерекқорында тек mprF генін анықтады, басқа резистенттілік детерминанттары анықталмады.
4. Филогенетикалық реконструкция және берілістерді бақылау
Ядро-геномның бір нуклеотидті полиморфизмі (cgSNP) талдауы Чжэцзян изоляттарын жаһандық филогенетикалық ағашта белгілі бір орынға қойды. Нәтижелер Чжэцзян штамдарының Ресей, Моңғолия және Қытайдың бірнеше солтүстік провинцияларынан (Нинся, Хэйлунцзян, Ішкі Моңғолия, Хэбэй, Ганьсу, Бейжің) алынған штамдармен бірге монофилді топ құрайтынын көрсетті. Бұл топ одан әрі үш бөлек кіші кладқа бөлінеді (1-3 клад), бұл бірнеше тәуелсіз интродукция оқиғаларын көрсетеді.
Қорытынды және салдарлар
Бұл зерттеу Чжэцзян провинциясындағы B. abortus туралы алғашқы жоғары дәлдіктегі геномдық деректер жиынтығын ұсынады және бірнеше негізгі қорытындылар береді:
- Клеar генетикалық фон– Чжэцзян провинциясында айналымда жүрген B. abortus штамдары ST2-ге жатады, геномдық тұрғыдан жоғары деңгейде сақталған және сиыр бруцеллезінің типтік тегін білдіреді.
2. Эвиаймақаралық беріліс жиілігі– Филогенетикалық талдау Чжэцзяндағы тәуелсіз эндемикалық тектің бар екенін растамайды. Керісінше, деректер бұл штамдардың Қытайдың солтүстігінен шыққанын және Ресей мен Моңғолия штамдарымен ортақ эволюциялық негізге ие болуы мүмкін екенін көрсетеді. Үш кіші кладаның болуы бірнеше бөлек интродукция оқиғаларын білдіреді.
3. Қоғамдық денсаулық сақтау саласының салдары– Зерттеу нәтижелері Чжэцзян сияқты дәстүрлі түрде эндемиялық емес аймақтарда да бруцеллезге геномдық бақылаудың маңыздылығын көрсетеді. Қазіргі жағдайлардың саны аз болғанымен, cgSNP сияқты жоғары ажыратымдылықтағы құралдар импортталған індеттердің көзін тиімді түрде бақылай алады және провинцияаралық мал тасымалдаумен байланысты беріліс тізбегін үзуге ғылыми дәлелдер келтіре алады.
Бұл жұмыс Чжэцзян провинциясындағы зерттеудегі олқылықты толтырып қана қоймай, сонымен қатар Янцзы өзенінің атырауы аймағында патогендерді бақылау және бруцеллез қаупін бағалау үшін жаңа бастапқы деректерді ұсынады.
Қағаз туралы ақпарат:
Yang, Y., Shi, X., Chen, J., Wang, L., Wu, Z., Yao, W., … & Wu, B. (2026). Қытайдың Чжэцзян провинциясындағы жеті Brucella abortus штаммын анықтау және филогенетикалық талдау. Cellular and Infection Microbiology журналындағы шекаралар, 16, 1758965.
Жарияланған уақыты: 2026 жылғы 10 маусым