Хэйлунцзяндағы кеміргіштердің «патогендік банкін» ашу: Ласса және хантавирустарды қоса алғанда, негізгі патогендер

Macro & Micro-Test компаниясының патогенді РНҚ-ны байыту жинағы
Жақында жүргізілген метагеномдық зерттеу Хэйлунцзян провинциясында кеміргіштер тасымалдайтын вирустар мен бактериялардың таңқаларлықтай алуан түрлі спектрін анықтады, соның ішінде Ласса вирусы, Амур вирусы, Сальмонелла және Yersinia pestis.

Зерттеуде қолданылдыMacro & Micro-Test компаниясының патогенді РНҚ-ны байыту жинағызондты түсіру технологиясына негізделген. Хосттың рРНҚ-сын және басқа сақталған хостың фрагменттерін селективті түрде азайту арқылы әдіс микробтық РНҚ-ны тиімді түрде сақтап қалды, бұл патогенді анықтау сезімталдығын айтарлықтай жақсартты. Патогеннің РНҚ-сын байытудың бұл қадамы жоғары анықтау деңгейіне жетуде маңызды болды және патогенді бақылау үшін күшті техникалық қолдау көрсетті.

Кеміргіштер: зооноздық аурулардың негізгі су қоймалары

Кеміргіштер - сүтқоректілердің ең көп түрге бай және кең таралған тобы, олар әлем бойынша 2000-нан астам түрді құрайды және барлық сүтқоректілер түрлерінің 40%-дан астамын құрайды.

Экологиялық маңыздылығынан басқа, кеміргіштер көптеген зоонозды патогендердің негізгі резервуары және тасымалдаушысы болып табылады.Кеміргіштердің тіршілік ету ортасы көбінесе адам қоршаған ортасымен қабаттасатындықтан — тікелей шағу, нәжіспен жанасу немесе бүргелер мен кенелер арқылы жанама түрде берілу арқылы — оларда болатын патогендер қоғамдық денсаулыққа тұрақты қауіп төндіреді.

Айта кету керек, жаңадан пайда болатын жұқпалы аурулардың 70%-дан астамы жабайы табиғаттан таралады, ал кеміргіштер вирустың ең маңызды резервуарларының бірі болып табылады.

Хэйлунцзян шекара аймағы: Патогендерді бақылаудың алдыңғы шебі

Қытайдың солтүстік-шығысындағы шекаралас провинция Хэйлунцзян экологиялық ресурстарға бай және бірнеше елмен шекаралас. Бай биоәртүрлілік пен халықтың шекарадан жиі көшіп-қонуы патогендердің таралуына қолайлы жағдай жасайды.

2021 жылдың маусым мен шілде айлары аралығында зерттеушілер Муданьцзян қаласының Хэндаохэзы қаласынан 67 жабайы кеміргішті жинады. Үлгілерге мыналар кірді:

л 20Аподемус түбегі

l 47Миодтар руфоканусы

Барлық үлгілер тұрғын аудандарда және айналасындағы ауылшаруашылық жерлерінде ұсталды, бұл адамдар қоныстанған жерлер мен жабайы табиғат мекендері арасындағы тығыз байланысты көрсетеді.
Micro-Test патогенді метагеномды анықтау жинағы

Патогендерді байыту технологиясы: Хосттың фонының кедергісін жеңу

 

Метагеномдық секвенирлеуде иесінің РНҚ-сы әдетте секвенирлеу көрсеткіштерінде басым болады, бұл патогеннің аз мөлшердегі сигналдарын жасырады.

 

Бұл қиындықты шешу үшін зерттеу қолданылдыMacro & Micro-Test патогенді метагеномды анықтау жинағы. Зондтарды түсіру технологиясын қолдана отырып, арнайы жасалған зондтар иесінің рРНҚ-сымен және сақталған тізбектерімен байланысады, бұл олардың азаюына мүмкіндік береді және осылайша микробтық РНҚ-ны байытады.

 

Бұл тәсіл патогенді анықтау сезімталдығын айтарлықтай жақсартты, бұл патогенді оқудың жоғары үлесін қалпына келтіруге мүмкіндік беретін кейінгі секвенирлеуді қолдануға мүмкіндік берді. Байыту кезеңі кеміргіштер тасымалдайтын патоген спектрін дәл сипаттау үшін берік негіз қалады.

 

Байытудан кейін РНҚ үлгілері кері транскрипциядан, кітапхана құрудан және жоғары өнімділік секвенирлеуден өтті. Биоақпараттық талдау мыналарды қамтыды:

 

Хост геномын сүзу

 

Kraken2 көмегімен таксономиялық жіктеу

 

l Bracken көмегімен молшылықты түзету

 

Бұл жұмыс процесі вирустық және бактериялық қауымдастықтардың жан-жақты профилін жасады.
Вирустық зерттеулердің нәтижелері

Зерттеу нәтижелері: Бірнеше вирустар мен бактериялардың бірлескен айналымы

 

Вирустық зерттеулердің нәтижелері

 

Анықталған вирустар 21 вирустық тұқымдасқа тиесілі болды, оның ішіндеАренавиридтержәнеХантавиридтер.

 

АрқылыжаңаданMegahit көмегімен құрастыру нәтижесінде 154 вирустық контиг жасалды, оның 110-ы сегіз тұқымдастан 19 вируспен сәйкес келді.

 

In Аподемус түбегі, келесі вирустар анықталды:

 

l Аренавирустар: Ласса вирусы, Вэнчжоу вирусы, Гайро вирусы

 

l Хантавирустар: Амур вирусы, Пуумала вирусы

 

In Миодтар руфоканусыЕгеуқұйрық артеривирусы және Амур вирусы анықталды.

 

Бұл патогендер арасында:

 

Ласса вирусы вирустық геморрагиялық қызбаның қоздырғышы болып табылады, өлім-жітім деңгейі шамамен 20%-ға жетеді.

 

Амур вирусы бүйрек синдромымен геморрагиялық қызбаның (БСҚҚ) қоздырғыштарының бірі болып табылады. Қытай хантавирус инфекцияларының жаһандық ауыртпалығының ең жоғары көрсеткіші туралы хабарлайды.

 

Бактериялық зерттеулердің нәтижелері

 

Барлығы 1051 бактериялық туыс анықталды.

 

Ең көп таралған тұқымдастар:

 

лСальмонелла(26–31%)

 

лЙерсиния(11–23%)

 

Сальмонеллатағам арқылы берілетін негізгі патоген болып табылады, жыл сайын әлем бойынша шамамен 9 миллион іш сүзегінің және шамамен 110 000 өлімнің себебі болып табылады.

 

Yersinia pestis, обаның қоздырғышы, үш тарихи пандемияға себеп болды. Хэйлунцзян провинциясы Қытайдың табиғи обаның ошақтарының бірі ретінде танылған және обаны бақылаудың басымдықты аймағы болып қала береді.
Зерттеудің маңыздылығы

Зерттеудің маңыздылығы

 

Ғылыми үлестер

 

Бұл зерттеу Хэйлунцзян кеміргіштеріндегі Ласса вирусының фрагменттері мен егеуқұйрық артериті вирусы туралы алғашқы есеп болып табылады, бұл Қытайдың кеміргіштер арқылы берілетін патогендердің дерекқорын кеңейтеді.

 

Ол жергілікті кеміргіштер популяцияларындағы вирустық және бактериялық қауымдастықтарды жүйелі түрде сипаттайды, шекаралас аймақтардағы зооноздық ауруларды бақылау үшін бастапқы деректерді ұсынады.

 

Қоғамдық денсаулық сақтаудың салдары

 

Зерттеу нәтижелері үздіксіз бақылау және патогендерді скринингтеу қажеттілігін көрсетедіA. түбегіжәнеM. rufocanus.

 

Деректер оба және бүйрек синдромымен бірге жүретін геморрагиялық қызба сияқты аурулардың бастапқы бақылау стратегияларын қолдайтын ғылыми дәлелдерді ұсынады.

 

Әдістемелік күшті жақтары

 

Метагеномдық секвенирлеу белгілі және жаңа патогендерді объективті түрде анықтауға мүмкіндік береді.

 

Бұл зерттеуде Macro & Micro-Test компаниясының патогендерді байыту технологиясы күрделі биологиялық үлгілердегі нысаналы патогендерді анықтауды тиімді түрде жақсартып, жоғары өнімділік көрсетті. Нәтижелер оның жабайы табиғатты бақылауда жоғары сезімталдықтағы патогендерді анықтауды қолдау мүмкіндігін растайды.

 

Өнім ұсынысы

 

Осы зерттеуде сәтті қолданылуына байланысты, Macro & Micro-Test Pathogen RNA байыту жинағы метагеномдық бақылау зерттеулері үшін өте ұсынылады.
Өнім ұсынысы

Бұл жинақ нуклеин қышқылдарын тиімді түрде азайтып, микробтық тізбектерді байыту арқылы анықтау сезімталдығын және деректер сапасын айтарлықтай жақсартады. Ол күрделі үлгілерде патогендерді дәл анықтаудың маңызды құралы болып табылады және қоғамдық денсаулық сақтауды бақылау, зооноздық тәуекелді бағалау және індетке дайындық үшін сенімді техникалық қолдау көрсетеді.

Contact to learn more: marketing@mmtest.com

 

 

 


Жарияланған уақыты: 2026 жылғы 2 наурыз