Туберкулезді диагностикалауға және дәріге төзімділікті анықтауға арналған жаңа қару: туберкулездің жоғары сезімталдық диагностикасын машиналық оқытумен біріктірілген жаңа буынның мақсатты реттілігі (tNGS)
Әдебиеттер туралы есеп: CCa: tNGS және машиналық оқытуға негізделген диагностикалық модель, ол бактериялық туберкулезбен және туберкулезді менингитпен ауыратын адамдар үшін қолайлы.
Диссертация тақырыбы: Туберкулезге бағытталған келесі ұрпақты секвенирлеу және машиналық оқыту: өкпе түтікшелері мен құбырлы менингитке арналған ультра сезімтал диагностикалық стратегия.
Мерзімді басылым: 《Clinica Chimica Acta》
IF: 6.5
Жарияланған күні: 2024 жылдың қаңтары
Қытай ғылым академиясы университетімен және астаналық медицина университетінің Бейжің кеуде ауруханасымен бірігіп, Macro & Micro-Test жаңа буын мақсатты реттілік (tNGS) технологиясы мен машиналық оқыту әдісіне негізделген туберкулезді диагностикалау моделін құрды, ол өте жоғары нәтиже береді. бактериялары аз туберкулезге және туберкулезді менингитке сезімталдықты анықтау, туберкулездің екі түрін клиникалық диагностикалау үшін жоғары сезімталдықты диагностикалаудың жаңа әдісін ұсынды және дәл диагностикаға, туберкулездің дәріге төзімділігін анықтауға және емдеуге көмектесті.Бұл ретте науқастың плазмасының cfDNA-сы ТБМ диагностикасында клиникалық сынама алу үшін қолайлы үлгі түрі ретінде пайдаланылуы мүмкін екендігі анықталды.
Бұл зерттеуде екі клиникалық когортты құру үшін 227 плазма үлгілері мен ми-жұлын сұйықтығы үлгілері пайдаланылды, онда зертханалық диагностикалық когорта үлгілері туберкулезді диагностикалаудың машиналық оқыту үлгісін құру үшін пайдаланылды, ал клиникалық диагностикалық когорта үлгілері белгіленгенді тексеру үшін пайдаланылды. диагностикалық модель.Барлық үлгілер алдымен Mycobacterium tuberculosis үшін арнайы жасалған мақсатты түсіру зонд пулымен нысанаға алынды.Содан кейін TB-tNGS секвенирлеу деректері негізінде зертханалық диагностикалық кезектің оқыту және валидация жиынтықтарында 5 еселік кросс-валидацияны орындау үшін шешім ағашының үлгісі пайдаланылады және плазма үлгілері мен ми-жұлын сұйықтығы үлгілерінің диагностикалық шекті мәндері алынады.Алынған шекті анықтау үшін клиникалық диагностика кезегінің екі сынақ жинағына енгізіледі және оқушының диагностикалық өнімділігі ROC қисығы бойынша бағаланады.Соңында туберкулездің диагностикалық моделі алынды.
1-сурет. Зерттеуді жобалаудың схемалық диаграммасы
Нәтижелер: Осы зерттеуде анықталған CSF ДНҚ үлгісінің (AUC = 0,974) және плазмалық cfDNA үлгісінің (AUC = 0,908) спецификалық шектеріне сәйкес 227 үлгінің ішінде CSF үлгісінің сезімталдығы 97,01%, ерекшелігі 95,65% болды және плазма үлгісінің сезімталдығы мен ерекшелігі 82,61% және 86,36% құрады.TBM пациенттерінен алынған плазмадағы cfDNA және цереброспинальды сұйықтық ДНҚ-ның 44 жұп үлгісін талдауда осы зерттеудің диагностикалық стратегиясы плазмадағы cfDNA және цереброспинальды сұйықтық ДНҚ-да 90,91% (40/44) жоғары консистенцияға ие және сезімталдық 95,45% құрайды. (42/44).Өкпе туберкулезімен ауыратын балаларда осы зерттеудің диагностикалық стратегиясы сол пациенттерден алынған асқазан сөлінің үлгілерінің Xpert анықтау нәтижелеріне қарағанда (28,57% VS 15,38%) қарағанда плазма үлгілеріне сезімталырақ.
2-сурет. Популяция үлгілері үшін туберкулезді диагностикалау үлгісінің талдау өнімділігі
