Туберкулез диагностикасына және дәрі-дәрмектерге төзімді анықтауға арналған жаңа қару: жаңа буынның мақсатты реттілігі (TNGS) туберкулезге сезімталдық диагнозын диагностикалауға арналған машиналарды оқытумен біріктірілген
Әдебиет туралы есеп: CCA: бактериалды туберкулез және туберкулезден аз және туберкулезден аз адамдарға арналған диагностикалық модель.
Диссертацияның тақырыбы: туберкулезге негізделген мақсатты, келесі бубалықтық реттілік және машинаны оқыту: өкпе құбырлары мен құбырлы менингитке арналған ультра сезімтал диагностикалық стратегия.
Мерзімді басылым: «Clinica Chimica Acta»
Егер: 6.5
Жариялау күні: 2024 жылғы қаңтар
Медициналық университеттің қытай ғылымдары академиясының және Пекиндік кеуде ауруханасының университетімен бірге, макро және микро-тест, макро және микро-тест, мақсатты реттіліктің (TNGS) технологиясы және станоктарды оқыту әдісі негізінде туберкулез диагностикасы моделін құрды, ол ультра жоғары Туберкулезге сезімталдығы бірнеше бактериялармен және туберкулезге қарсы менингитпен сезімталдығы бірнеше гиперсензертивтілік диагнозын диагностикалаудың жаңа әдісі ұсынылды Туберкулезбен, дәл диагноз қоюға, дәрі-дәрмектерге төзімділікті анықтауға және туберкулезбен емдеуге көмектесті. Сонымен бірге пациенттің плазмалық CFDNNNNNNA-ны ТБМ диагнозымен клиникалық іріктеу үшін қолайлы үлгі түрінде қолдануға болатындығы анықталған.
Осы зерттеуде екі клиникалық когорттарды құру үшін 227 плазмалық сынамалар мен церебинальды сұйықтықтың үлгілері қолданылды, онда екі клиникалық когорттарды құру үшін пайдаланылды, оларда туберкулез диагностикасының машиналық моделін құру үшін зертханалық диагностикалық үлгілер қолданылды, ал клиникалық диагностикалық коалогтық үлгілер орнатылды Диагностикалық модель. Барлық үлгілер алдымен микобактерия туберкулезіне арналған арнайы жобаланған мақсатты басып алу пулымен мақсатты болды. Содан кейін, TB-TNGS-тің мәліметтерін реттейтін мәліметтер негізінде, шешім ағашы моделі зертханалық диагностикалық кезектің жаттығу және тексеру жиынтығы бойынша 5 есе тексерілу үшін қолданылады, ал плазмалық үлгілердің диагностикалық шектері мен церебинальды сұйықтықтың үлгілері алынады. Алынған табалдырық диагностикалық диагностың екі жиынтығына енеді, ал оқушының диагностикалық қойылымы РОК қисығы бағаланады. Соңында, туберкулездің диагностикалық моделі алынды.
1-сурет. Зерттеу дизайнының схемалық диаграммасы
Нәтижелер: осы зерттеуде CSF DNA үлгісінің (AUC = 0.974) және плазмалық CFDNA үлгісі (AUC = 0.908), 227 үлгілердің ішінде анықталды, 227 үлгілердің ішінде CSF үлгілерінің сезімталдығы 97,01%, ерекшелігі 95,65% құрады, ал Плазмалық үлгінің сезімталдығы мен ерекшелігі 82,61% және 86,36% құрады. Плазмалық CFDNA және Цереброминальды сұйықтықтың 44 жұпталған үлгілерін және цереброминальды сұйықтық ДНҚ-ның, осы зерттеудің диагностикалық стратегиясы 90,91% (40/44), плазмалық CFDNA және церебинальды сұйықтық ДНҚ-да жоғары консистенцияға ие және сезімталдық 95,45% құрайды (42/44). Өкпе туберкулезі бар балаларда бұл зерттеудің диагностикалық стратегиясы бірдей науқастардан жасалған асқазан шырындарының үлгілерінің Xpert анықтау нәтижелеріне қарағанда плазмалық үлгілерге сезімтал (28,57%, 15,38%).
2-сурет. Халық үлгілері үшін туберкулез диагностикасының моделін талдау
3-сурет. Жұпталған үлгілердің диагностикалық нәтижелері
Қорытынды: Бұл зерттеуде туберкулезге арналған сезімтал диагностикалық әдіс құрылды, ол диагностикалық құралды, ол олигобациллярлы туберкулезі бар клиникалық науқастарға жоғары анықтауға сезімталдығы бар диагностикалық құрал бере алады (теріс мәдениет). Плазмалық CFDNA-ның жоғары сезімтал туберкулезін анықтау Белсенді туберкулез және туберкулездендірілген менингит диагностикасы үшін қолайлы үлгі түрі болуы мүмкін (плазмалық үлгілерде мидың туберкулезіне қатысы бар).
Түпнұсқа Сілтеме: https://www.science/artical/artication/pii/s0009898123004990? % 3Dihub арқылы
Макро және микро-тестілеудің туберкулезді анықтау өнімдерін қысқаша енгізу
Туберкулезбен ауыратындардың күрделі жағдайын ескере отырып, макро және микро-тест, макро және микро-тест, қақырық үлгілерінен сұйықтықты алу, Qualcommment Cental Company және SEQUENCERING және мәліметтерді талдау үшін NGS шешімдерінің толық жиынтығын ұсынады. Өнімдер туберкулезбен ауыратын науқастардың тез диагнозын, дезенкулезге төзімділікті, мукобактерия туберкулезінің және NTM-дің теруін, бактериялардың сезімталдық диагнозын, туберкулездің сезімталдық диагнозын және т.б.
Туберкулез және микобактериялар үшін сериялық дақылдар жиынтығы:
| Жоқ тармағы | Өнім атауы | Өнімді сынау мазмұны | Үлгі түрі | Қолданылатын модель |
| HWTS-3012 | Үлгі шығарылымы | SPUTUM үлгілерін сұйылту кезінде қолданылған, бірінші дәрежелі рекордтық нөмір, Sutong Machies жабдықтары 20230047 алды. | қақырық | |
| Hwts-ngs-p00021 | Гиттерсенсивті туберкулезге арналған сандық анықтама жиынтығы (зондты түсіру әдісі) | Инвазивті емес (сұйық биопсия) бактериялар үшін сезімталдық сезімталдықтың сезімталдығы - жағымсыз өкпелік туберкулез және ми түйіні; Туберкулезбен немесе туберкулезбен ауырмайтын микобактериялармен жұқтырылған адамдардың үлгілері жоғары тереңдігі бар метагеномикамен және туберкулезбен немесе туберкулезге немесе туберкулезге жатпайтын мукобактериялармен және макобактерия туберкулезінің негізгі алғашқы есірткіге төзімділігі туралы ақпаратпен талданды берілді. | Перифериялық қан, альвеолярлы ара сұйық, гидротеакс және асцит, фокус пункциясы, церебинальды сұйықтық. | Екінші буын |
| Hwts-ngs-t001 | MyCobacterium теру және дәрі-дәрмектерге төзімді анықтау жинағы (мультиплексті күшейту әдісі) | MyCobacterium теру сынағы, оның ішінде MTBC және 187 NTM;Микобактерия туберкулезінің драорлық кедергісі 13 есірткі және дәрі-дәрмектерге төзімділіктің 16 негізгі мутацияланған учаскелерін қамтиды. | Қақырық, альвеолярлы ара альвеолары, гидротеакс және асцит, фокус пункциясы, церебинальды сұйықтық. | Екінші / үшінші буын қос платформасы |
Бақыт ерекшеліктері: HWTS-NGS-T001 микобактериялы микобактерия теру және дәрі-дәрмектерге төзімді анықтау жиынтығы (мультиплекстікті күшейту әдісі)
Өнімді енгізу
Өнім Кім Туберкулезбен емдеу жөніндегі нұсқаулықтар, макролидтер және аминогликозидтер, әдетте, NTM емдеу ережелерінде қолданылады, және дәрі-дәрмектерге төзімді учаскелерде дәрі-дәрмектерге төзімділіктің барлық топтарында сипатталған негізгі және екінші сызыққа негізделген. Микобактерия туберкулезінің күрделі каталогы, сондай-ақ басқа да дәрі-дәрмектерге төзімділік гендері мен мутациялық учаскелер, сонымен қатар жоғары скорцинаның статистикасы және мутация учаскелері Үйде және шетелде әдебиеттер.
Теруді сәйкестендіру NTM-дің NTM штамдарына негізделген, олар Қытайдың туберкулез және тыныс алу аурулары журналы және сарапшылардың консенсусымен жарияланған NTM нұсқауларында келтірілген. Жобаланған теру праймерлері 190 NTM түрлерінің 190-нан астам түрін күшейтеді, реттілік және түсініктеме алады.
Мақсатты мультиплекс ПТР күшейту технологиясы арқылы макобактериялардың генотиптер мен есірткіге төзімді гендері, ал анықталған мақсатты гендердің ампликон үйлесімі алынды. Күшейтілген өнімдерді екінші буында немесе үшінші буынның жоғары өткізу кітапханаларына салынуы мүмкін, ал екінші буынды және үшінші буындық және үшінші буындық тізбекті платформаларда мақсатты гендердің реттілік туралы ақпаратын алу үшін тереңдетілген реттілікке ұшырайды. Кіріктірілген анықтамалық мәліметтер базасындағы белгілі мутациялармен салыстырғанда (оның ішінде Mycobacterium туберкулезінің күрделі мутациялық каталогы және оның есірткіге төзімділігімен байланысы), дрезиденттік кедергісі немесе туберкулезге қарсы препараттардың сезімталдықпен байланысты мутациялар анықталды. Макро және микро-тестілеудің өзін-өзі ашқан шашыратқыш ерітіндісімен бірге, клиникалық қақырық үлгілерінің төмен нуклеин қышқылын күшейту мәселесі (дәстүрлі әдістерге қарағанда он есе көп) шешілді, сондықтан дәрі-дәрмектерді жүйелі түрде қабылдау шешілді спиникалық қақырық үлгілеріне тікелей қолданылады.
Өнімді анықтау диапазоны
34Дәрілік заттарға төзімділігі бар гендер18Туберкулезге қарсы дәрі-дәрмектер және6NTM есірткі анықталды, жабыны297Дәрілік заттарға төзімділік учаскелері; Микобактерия туберкулезінің он түрі және одан да көп190NTM түрлері анықталды.
Кесте 1: 18 + 6 есірткі туралы ақпарат + 190 + NTM
Өнімнің артықшылығы
Күшті клиникалық бейімделу: SPUTUM үлгілерін мәдениетті өздігінен сұйытқыш агентімен тікелей анықтауға болады.
Эксперименттік операция қарапайым: Күшейту операциясының бірінші кезеңі қарапайым, ал кітапхананың құрылысы 3 сағат ішінде аяқталады, бұл жұмыс тиімділігін арттырады.
Кешенді теру және есірткіге төзімділік: Клиникалық қамтудың негізгі нүктелері, дәл теру және дәрі-дәрмектерге төзімді анықтау, дербес теру және дәрі-дәрмектерді анықтайтын, бір рет басу арқылы талдау есептерін қолдайтын MTB және NTM теру алаңдарын жабу.
Сыйысымдылық: өнім үйлесімділігі, негізгі ILM және MGI / ONT платформаларына бейімделу.
Өнім сипаттамасы
| Өнім коды | Өнім атауы | Анықтау алаңы | Еректерлер |
| Hwts-ngs-t001 | Микобактерия теру және есірткіні тексеру жинағы (мультиплексті күшейту әдісі) | Онт, Илулумина, МГИ, Salus Pro | 16 / 96rxn |
POST уақыты: қаңтар-23-2024